بر اساس قانون خالکوبی کردن در شرایط خاصی جرم به حساب می‌آید.
اگر چه در فرهنگ و عرف غالب مردم ایران، خالکوبی امری متداول نیست، اما به واسطه آن که در قانون برای آن مجازاتی تعیین نشده پس جرم به حساب نمی‌آید.
البته اگر شخصی تصاویر مستهجن یا عجیبی را مثلا در صورتش خالکوبی کند، در این صورت می‌توان این عمل را به دلیل جریحه دار کردن عفت عمومی، تحت عناوین مجرمانه دیگر قابل مجازات دانست.
هرچند خالکوبی خلاف قانون نیست، اما به دلیل اینکه در جامعه ایرانی عرف نمی‌باشد، ممکن است هنگام استخدام در ادارات دولتی و یا تحصیل در مدارس و دانشگاه‌ها مشکلاتی را ایجاد کند، به ویژه اگر تصویر مربوطه در قسمت‌های نمایان بدن انسان حک شده باشد.
اکثر مراجع و فقهای مشهور معتقدند که چنانچه موجب ضرر جسمی برای شخص نباشد؛ سلامت وی را تهدید نکند و حاوی تصاویر مستهجن نباشد، حرام نبوده و منع شرعی ندارد.
وزارت بهداشت برای کسانی که اقدام به خالکوبی و تتو و پیرسینگ می‌کنند، محدودیت‌های خاصی وضع کرده و انجام آن در آرایشگاه‌ها و دیگر اماکن در صورتی که زیر نظر پزشک نباشد، ممنوع است.