به گزارش مشرق، محسن خلیلی بین سال‌های ۸۶ تا ۸۹ برای پرسپولیس بازی کرد و در این سه سال ۳۰ گل برای تیمش به ثمر رساند.

محسن خلیلی در اینستاگرام خود نوشت:

«ریاکاری بلد نیستم و تلاش می‌کنم دروغ هم نگویم. پس صادقانه اعتراف می‌کنم بسیار خوشحالم که به خانه‌ام برگشته‌ام، به باشگاهی که بخش زیادی از لحظات خوش زندگی‌ام را بعد از لطف خداوند و دعای هواداران و خانواده‌ام، مدیون آن هستم.
از هیأت مدیره باشگاه و جناب آقای عرب به خاطر اعتمادشان، سپاسگزارم. امیدوارم از پس مأموریتی که به من سپرده‌اند به خوبی بربیایم.
دست تک تک پیشکسوتان باشگاه را می‌بوسم و از آن‌ها رخصت می‌گیرم. برای من افتخار است که روی نیمکتی بنشینم که در سال‌های اخیر، بزرگان خوشنامی مانند محمود خوردبین، دکتر محمد زادمهر، زنده یاد دکتر ابراهیم آشتیانی، محمد پنجعلی، افشین پیروانی و مصطفی قنبرپور نشسته‌اند.
چند جمله آخر را خطاب به هواداران عزیز پرسپولیس می‌نویسم: شما بهتریند، بهترین در ایران و بهترین در دنیا. به پشتوانه لطفی که همیشه به من داشته‌اید و حمایتی که کرده‌اید، این مسئولیت مهم را پذیرفته‌ام. امیدوارم از این پس هم لطفتان را از من که سرباز پرسپولیس بوده‌ام، هستم و خواهم ماند، دریغ نکنید.»